Les éditeurs de texte ne modifient pas aisément les ePubs.
La meilleure solution que j’ai trouvée, c’est:

    • Retouche ePub (tweak_epub_fr.exe) pour « éclater » la structure du livre.
    • Kompozer pour l’édition proprement dite.

Chez MRD, ces 2 logiciels se trouvent dans mon DropBox (dossier eBooks)

Retouche ePub

A l’ouverture du programme, une fenêtre s’ouvre, qui permet la sélection du livre à modifier.
Une fois le fichier renseigné, sa structure est affichée:

Ouvrir le fichier .html voulu avec Kompozer.
Kompozer

Exécuter les modifications souhaitées, enregistrer, et repasser à Retouche ePub.
Cliquer sur « Aperçu… »   pour vérifier le résultat. Le livre s’ouvre avec la liseuse par défaut sur le PC (pour MRD, Calibre).
Cliquer sur « Enregistrer les changements » pour finaliser les modifications.